安徽农垦教育是伴随着农垦事业的创建而诞生的。从50年代中期起，省属国营农场相继办起了职工子弟中学。1958年7月，中共安徽省委农村工作部发出了《关于场站办学校的通知》；是年底，华阳河、寿西湖、焦岗湖办起了农业机械化学校，共开11个教学班，在校学生625人。
60年代，既是农垦教育的兴旺时期，又是衰败时期。1961年，根据毛泽东提出学习“江西共产主义劳动大学”的号召，安徽农垦先后有14个场办起了半工半读农垦学校或半工半读农业专科学校。1962年3月，省农业厅党组《关于场办农专进行调查意见的报告》统计，当时在校学生3003人。1966年，“文化大革命”开始后，农垦教育摧残殆尽，学校停办，教师“斗、批、走”，设备遭破坏。
70年代，是安徽农垦教育恢复发展时期，当时的农场隶属于安徽生产建设兵团。兵团教育自成体系，兵团各级宣传部门负责对教育进行行政业务领导。这个时期，正值中小学学生入学高峰，兵团提出的办学口号是：连队办小学，营部办初中，团部办高中。据1977年统计，兵团共办小学210所，在校学生30911人；初中37所，在校学生11326人；高中17所，在校学生2572人。
80年代，是安徽农垦教育的调整、充实，提高时期。1975年，兵团撤销，恢复农垦厅建制。厅政治部设宣教科，配备专职管理教育工作的干部，对全系统教育工作实行宏观管理。下属大农场设教委或教育科，小农场在政治处设专职或兼职教育干事管理学校。教学业务按省教委规定，由地方教委代管。由于实行了计划生育，农垦生源逐年递减。据1990年统计，有各类学校153所，其中小学114所，教职工1013人，在校学生1．19万人；中学36所，教职工1161人，在校学生1．13万人；职业高中2所，在校学生864人；技工学校2所，教职工24人，在校学生97人；中专学校1所，教职工75人，在校生292人。