1950～1957年，农场初建时期，条件艰苦，缺医少药，国营农场没有卫生所或卫生院，只有少数跟班劳动的田头卫生员。随着垦荒面积不断扩大和农垦职工队伍日渐增加，农场开始组建卫生所或卫生院，如华阳河、寿西湖、普济圩、方邱湖、正阳关、潘村湖等农场，十字铺茶场、砀山果园场等。皖河农场成立了联合诊所。一般设中西医门诊，少量简易病床，设备简陋，医疗条件差，只能治疗小伤小病，输液、使用抗生素都有困难，病情稍重就要转院。
1958～1968年，为解决好大批下放到农场的干部和知识青年的医疗问题，华阳河、皖河、普济圩、潘村湖、龙亢、白米山等农场，十字铺茶场、砀山果园场等相继成立了医院，部分管理区成立了卫生所，添置了一些医疗器械，如显微镜，30、50、100毫安X光机等，医疗条件有所改善，医疗水平相应提高。
1969～1975年，安徽生产建设兵团时期。兵团按军队建制，设立卫生行政机构：兵团设卫生处，师设卫生科，团设卫生队，营设卫生所。三师医院及各团卫生队由农场医院易名，并调入了部分军队卫生人员，添置了一些医疗设备，如200毫安X光机、救护车等。扩建了一些医疗用房，新建了一师、二师、四师3个师级医院。农垦卫生事业有较大发展，华阳河总场医院（三师医院）职工猛增至140余人，能开展上腹部手术，解决较疑难病例，其他3个师级医院的医疗设备和医疗水平大体相仿。普济圩农场医院有病床150张，可开展胸腔手术。
1976～1990年，为调整发展时期。1976年兵团撤销后，大部分军队卫生人员调离，医疗设备流失，甚至整个医疗机构被地方无偿占去。兵团部的全部医疗设备被几个单位瓜分，一师、二师、四师医院被地方无代价的接收，导致农垦卫生事业滑坡，医疗水平降低。80年代以来，随着农垦经济的发展，农垦卫生事业也相应得到发展，大多数农场都注意加大对卫生事业的投资，农场医院新建、扩建了三、四层楼房的门诊部、住院部、办公室和宿舍楼，新购300、500毫安X光机、纤维胃镜、B型超声诊断仪、平普仪、脑电图、救护车等大型医疗设备。如华阳河、皖河、普济圩、龙亢、寿西湖、水家湖、正阳关等农场医院，十字铺茶场、砀山果园场医院等。培养和引进了大批技术人才，仅正规学历培训和引进具有高、中级职称的医务人员就有100多人。1990年，全系统有场级医院29所，分场（管理区）级卫生所45个，卫生人员1333人，其中具有高、中级技术职称的148人，每百人有卫生技术人员1．9人。全系统有病床1250张，每百人有病床1．8张。
农垦卫生医疗单位为了做到文明行医，优质服务，根据《安徽省文明医院检查标准》组织对照检查。通过评比，皖河、普济圩、龙亢、正阳关、潘村湖、大圹圩等农场医院，十字铺茶场医院被评为农垦系统文明医院。普济圩、皖河农场医院还分别被评为铜陵市、安庆市文明医院。