医疗1949年前，九华山有民间郎中和僧伽行医。九华街沈广裕、王世荣、刘万泰三家商号设中药铺。1950年后药铺关闭。

1950至1957年，宏瑞等几名僧尼零星为人看病。1958年，柯村医院(今九华乡医院)派一名医生驻山，定期轮换。至此，九华山缺医少药的状况稍有改变。

1970年9月，九华大队创办合作医疗室，有3名经过培训的“赤脚医生”和一名药农。内设中药柜。合作医疗室只医治一般性疾病，遇有重病号则转送医院。

1980至1981年，青阳县医院、宣城地区卫生局和上海设在贵池的长江医院先后派出一支4人医疗队常年驻山，诊所设在新龙庵。

1982年，九华山人民医院正式成立，由管理处划拨基建科四间房子作为院址。现有医务人员9人。医院业务领导先归宣城地区卫生局，后划属芜湖市卫生局。

1984年，医院新址落成(今香炉石九华山学校右侧)。内设门诊部、住院部和药房。医院对游人开放，昼夜提供服务。多数的病人可就地治疗，少数患者因诊治科目和医疗器械不全，仍须转院。

自九华山对外开放以来，医疗卫生条件不断改善，游人及当地山民求医看病，基本上都能得到及时治疗。

食品卫生1986年前，九华山未设食品卫生监督组织。1987年元月，管理处卫生防疫站(简称防疫站)开始实施食品卫生监督管理。6月，防疫站对全山360名食品生产经营人员进行了身体健康检查，并举办食品从业人员卫生培训班。凡符合《食品卫生法》第25条之规定的人员，均发放生产经营健康证；不符合规定的，取消生产经营的资格。随后，防疫站经常开展食品卫生检查。全山饮食服务单位和个体生产销售的食品，符合《食品卫生法》第二章之规定的，准予生产经营；违背者，根据不同情况，分别处以罚款，限期整改，或责令停业整顿；不服从监督管理的，在工商行政管理部门的配合下，吊销其营业执照。因在食品从业人员中认真贯彻执行《食品卫生法》，有效地防止了妨害游人身体健康的不卫生行为。1987年后，各饮食服务单位和个体饮食摊点，无论是食品还是外观环境卫生状况良好。

自1985年以来，管理处多次举行全山范围内大规模灭鼠工作，鼠患得到了有效控制。

九华山饮用水经检测，符合卫生标准。

环境卫生清末，九华山居民集中居住在王家寨(今小天台寺附近)，商人妻室概不准进入九华街，且严禁香客游人携带妇女朝山进香，借宿僧舍。妇女朝山被视为秽污佛地。街区除寺院有报晓雄鸡外，一律不准饲养禽畜。各寺庙、商号有僧头和伙计负责清除环境卫生。民国时期，商人妻室迁往九华街定居，妇女朝山礼佛开禁，山中垃圾、粪便渐多，但指定地点排放，因而环境清洁。

1979年，九华山对外开放后，管理处爱国卫生运动委员会、“五讲四美三热爱”活动办公室、环境卫生管理所、农林科等单位大力协作，综合治理环境卫生。环境卫生管理所承担了全山环境卫生工作。该所配备吸粪车和小型垃圾运输车各一辆。主要任务是负责清扫交通要道、公共场所的垃圾，管理旅游厕所，全山垃圾及时得到清除。

1985年3月，各单位实行了周末卫生大扫除制度。九华街区落实了“门前三包”卫生责任制，并制定了“四圈一禁养”(圈鸡、鸭、鹅、猪，禁养家犬)制度，其中规定党政机关工作人员实行五禁养，景区景点定人定点清扫，管理处还陆续在主要景点新建旅游厕所 6座。

为绿化、美化环境，广泛开展种花植树工作，近9年来，野外培栽花卉和名贵树木百余种，绿化面积2300亩。

1984至1985年，经芜湖市环境保护监测站检测，九华山大气污染程度低，符合对外开放要求。