县内鱼类疾病主要有赤皮病、烂鳃病、肠炎病等。1984年，蔡城塘鱼场鱼病发生多达13种，死亡率占发病数的75％左右，是县内鱼病集中多发区。戴集、四树、三十头、朱巷、吴山、史院、杨公等地均有不同程度的鱼病危害。
在建县后的很长一段时间内，民间对鱼类疾病很少采取防治措施，鱼场也只是对精养鱼塘鱼类的疾病采取一些防治措施。80年代后，农村的普养鱼塘对鱼病仍缺乏防治措施，鱼场和专业户以及农民开挖的精养鱼塘则对主要鱼病采取有效防治措施。
打印病，又称腐皮病，是本县亲鱼的主要病害，多发生于春秋两季。县于发病季节用1ppm的漂白粉泼洒消毒的方法预防；发病后，用0.1至0.2ppm的呋哺唑酮或1ppm的漂白粉遍洒治疗。
烂鳃病，县境4至10月份盛行，多发生于精养鱼塘，主要危害青、草、鳙、鲤等鱼。宜采用保持水质清爽、丰富天然饵料方法预防。放养时发现此病则用硝酸亚汞、金霉素或土霉素洗浴消毒。出现此病后，用硝酸亚汞0.1至0.2ppm或五倍子2至4ppm泼洒的方法治疗。
出血性腐败病，又称赤皮病，赤皮瘟，是县内青、草鱼种和成鱼的主要疾病，常与烂鳃病、肠炎病并发。1985年，永丰鱼场亲鱼繁殖时，由于操作不慎，鱼体受伤患此病，当年6月至8月亲鱼陆续死亡80多尾。戴集乡一养鱼专业户饲养的成鱼患此病，死亡率达40％。县对此病用内外结合的方法治疗：第一天每百斤鱼内服5克磺胺噻唑，第二天至第六天将2.5克磺胺噻唑拌入饲料投喂，同时用漂白粉1ppm、硝酸亚汞0.1ppm或五倍子2至4ppm遍洒全塘。
肠炎病，4月中旬至8月底在县内流行，青、草鱼最易感染此病，死亡率达90％以上。多采取清塘消毒、常换清水和定期用生石灰遍撒鱼塘的方法防治。