1951年冬土地改革后，淮河渔区部分贫苦渔民，自发组织了93个临时性、季节性互助组。入组人数1767人。其后，各级水产部门进行层层发动，大力宣传，加速了淮河渔区渔民互助合作化运动的发展。1952年，临时互助组发展到239个，1953年发展到800多个。其中37个提高为常年互助组。初步实行民主管理和简单的劳动协作。但互助组没有明确章程，渔具私有，不能统一调配使用。产品又实行伙打平分，因而存在着平均主义现象。1954年常年互助组发展到203个。同时全省建立起32个半社会主义性质的渔业初级合作社。初级社渔具私有公用，劳力统一调配，初步实现了劳力、工具、渔场三统一，生产比单干和互助组有了较大提高。收益主要根据渔民劳动和入社工具情况统一分配，并有了少量公共积累。到1955年9月底，这种初级社发展到59个，入社渔民1558户，占全省专业渔民总户数的8.1％。常年互助组发展到824个。
1955年底，全省掀起农业合作化高潮，到1956年春，全省绝大部分个体渔民参加了互助合作组织。紧接着，渔业初级社又迅速向高级社过渡。1956年5月统计，全省已组织渔业社169个，入社渔民9829户，占专业渔民总户数的70.6％，其中高级渔业社145个，入社渔民9086户，占专业渔民总户数的65.4％。由于实行合作化要求过急，工作过粗，改变过快，形式也过于简单划一，以致带来一系列问题：一是破坏了自愿互利政策，暂时不愿入社的渔户也被迫勉强入社。船网折价普遍偏低，损害了一部分渔民的利益。二是有些社的生产队规模过大，不便于生产和领导，有些没有实行“包工包产值，超产值归队，减产值赔偿”的管理办法，影响社员的生产积极性；有些社账目不清，财务混乱，引起社员疑虑和不满；有些社没有贯彻民主办社和勤俭办社的方针；某些渔区甚至有闹退社的情况发生。三是分红不及时兑现，片面强调积累，忽视了社员分配，积极性受到一定程度的影响。
对于渔业合作社出现的问题，1957年6月，中共安徽省委批转了省委农工部关于整顿渔业生产合作社的报告，决定对渔业社分批进行整顿。其主要内容是：贯彻自愿互利政策，重申入社自愿，退社自由；建立健全渔业社的管理制度，广泛推行“包工包值，超产值归队，减产值赔偿”的办法；在积累和分配上，提取公积金不得超过总收入的10％，对员分配不得低于50％；划小生产队规模，一般以5～6条船为一队，最多不得超过10条为一队；普遍进行民主办社，勤俭办社方针教育；实行生产民主，分配民主，管理民主，财务公开。同时把一定权限下放到生产队，推行财务包干办法。渔具实行包费用、包用期，以减少开支，降低成本，增加社员收入。为了进一步贯彻上述政策，安徽省水产局还举办了全省渔业社干部训练班，进行合作社政策和渔业社管理教育，提高干部的政策和业务水平。经过整顿，绝大多数渔业合作社稳定下来。同年底，全省共有渔业社137个，入社渔户10303户，其中初级社6个，559户。另有12个互助组，103户。此外，还有2万多户渔民分别参加当地农业社，组成农渔结合社或水产队，至此基本实现了合作化。同年，97％的渔业合作社增产增收。渔民年终分红人均75.40元。1958年全省渔船达到22000多艘，比1950年增加46％。少数渔业合作社还购置了机帆渔船，为集体渔业的技术改造做出了示范。
1966年中共中央发出《关于加速连家船社会主义改造的通知》（以下称“连改”），通过试点，1967年“连改”工作在安徽全面展开。“连改”的主要内容是：连家船生产资料折价归集体所有；建立固定的生产生活基地，走养捕结合，以渔为主，多种经营，全面发展的道路。在此基础上，动员渔民上陆定居，建立渔民新村；实行定产、定工、定本，按劳分配的制度。后因左倾错误的影响，1968年至1970年，全省有3031户渔民，16234人被强迫弃渔从农，并注销渔民粮油供应。一些农业公社强占了渔民生产生活基地，使渔民“连改”工作受到很大影响。1973年，中共安徽省委、省革命委员会，根据中央有关通知精神，开始纠正这种左的编差，并从省级财政拨款800多万元，支持“连改”。这一工作前后进行了10多年，到1977年全省有64000多连家船渔民（占连家船渔民总数的70％以上），在国家的支持下，上陆定居。“连改”工作对恢复和增殖水产资源，促进养殖发展，起了很好的作用。同时，由于实行多种经营，增加了渔业收入，提高了渔民的物质和文化生活。
1980年后，为了适应当时的生产力水平，调动渔民的生产积极性，在农业生产责任制影响下，逐步实行渔业生产责任制，恢复和发展了以船为核算单位的生产组织，大大促进了渔业生产的发展。1984年全省15个渔业公社，170个渔业大队，770个生产队的渔业总收入达4500多万元，人均净收入310元，收入高的劳力3400多元。