清末至民国时期，本县城乡环境污染轻微。解放后，随着工业生产的发展，工业“三废”(废水、废渣、废气)增加，机动车辆增多，加之剧毒农药的广泛使用，城乡环境污染日趋严重。环境保护问题引起中共南陵县委和县人民政府的关注。1984年10月，成立县环境保护监测站，配备环保监测人员6名，其中大专毕业生3名，技术员1名。建立了实验室，购置了分析天平、分光光度计、大气采样器等仪器设备，监测手段日臻完善，加强了环境保护法规的宣传，对环境治理已纳入正常轨道。
一、污染源
1985年，县城建环保部门举办污染源调查技术培训班，始对全县87个企业和医院环境污染状况进行调查，建立卡片80份，对12个较大的企业或污染严重的单位建立了表格登记簿60本，并对全县10个企业和医院的废水、废渣进行抽样化验，取样193个，对其污染成份进行分析。1990年全县废水、废渣、废气和噪音的污染情况如下：
废水年排放工业废水123.75万吨(其中城关地区工业废水119.89万吨、乡镇工业废水3.86万吨)，生活污水年排放量97.67万吨。废水中含有GＯD98.96吨／年，BOD184.98吨／年，硫化物3.023吨／年，砷0.0094吨／年，挥发酚0.005吨／年，六价铬0.19吨／年。废水污染来自三类，一是碳化合物、蛋白、油脂、木质素等，来源于食品加工厂、豆制品厂(作坊)、化肥厂、棉织厂、毛巾厂、酒厂、造纸厂、缫丝厂、植物油厂、三里清溪宣纸厂等企业；二是有毒物质，七种金属和有机氯、有机磷、农药等，来源于农药厂、印刷厂、金属机械加工、化验等；三是各种病源微生物(病毒、病菌)寄生虫等，来源于大量的生活排污、人畜粪便、医院病毒、屠宰等。主要纳污体是市桥河、漳河、青弋江、后港河等。根据县环境监测站1989年对市桥河水的测定，其污染物最高浓度是悬浮物92毫克每升，COD64.7毫克每升，BOD56.95毫克每升，均已超过国家规定地面水标准。市桥河已成为藏污纳垢的场所，大量建筑垃圾倒入河中，造成河窄水浅，杂体丛生，腐败物覆盖水面，加之人畜粪便流入，水质变黑发臭。居民怨叹市桥河“60年代淘米洗菜，70年代洗衣浇菜”。有鉴于此，县人民政府制定了市桥河治理规划，正在组织人力实施中。
废气全县有2吨以上工业用锅炉13台，有各种窑炉206座，年耗煤量54359吨，其中全民、集体企业煤耗31421吨，乡镇企业耗煤22938吨，年排放粉尘3496.8吨。废气污染源是化肥厂、酒厂、毛巾厂、水泥厂、轮窑厂和石灰厂等。1990年根据环境监测站统计，全县大气中含有SO2706.56吨，CO2099.2吨，NO345.7吨，烟尘1754.8吨，粉尘4554.9吨，氟化物52.79吨，废气排放总量66446万标立方米。
废渣全年工业固体废弃物排放总量约10860吨，其中锅炉排渣3567吨，尾矿渣460吨，工业垃圾100吨，粉尘3083.31吨。城关生活垃圾排放量1.04万吨。废渣主要源于化肥厂、水泥厂、白水泥厂、轮窑厂以及矿山尾渣等。
噪音噪音来自县化肥厂、大米加工厂、铰链厂、芜湖拖拉机厂等一些工厂坐落城内，影响居民生活和休息。机动车辆的喇叭噪声也日趋严重。
二、危害状况
“三废”排放量增多，使本县生态环境受到严重危害。县化肥厂、水泥厂、轮窑厂周围的禾苗、树木经常枯死。特别是轮窑厂排放的废气，污染桑叶，导致蚕死亡。市桥河沿岸居民向水体倾倒垃圾，加上工业废水排入，造成水体富营养化，河水黑绿发臭，纺织企业浆染污水，超过国家标准约10倍。
市桥河、漳河沿岸居民在使用污染水后，呼吸道疾病和肝脏疾病增多，胃肠道疾病上升。80年代以来，森林面积减少，水土流失严重，使本县生态环境质量变差。同时，由于淤积的泥沙造成河床抬高（1953～1990年漳河河床抬高约2米），加剧洪涝灾害。水土流失，还造成土壤肥力下降，珍稀动植物逐年减少。
三、污染治理
县环境保护监测站成立后，加强对老污染源的监督管理，促进“三废”治理。主要措施是征收排污费，用经济杠杆，促使企业进行技术改造。进行“三废”治理，开展综合利用，减少污染物的排放量。至1990年末，共收排污费37万元，70%用于企业治理，先后给化肥厂、自行车配件厂、橡胶厂等单位，上了8个项目，竣工7个，年处理废水约2万吨、废气12661万标立方米、废渣综合利用量0.9万吨。
1987年，弋江自行车配件厂自筹资金10万元，市环保局贷款5万元，购回一套无锡环保设备厂生产的气浮式水处理设备，建成一座水处理车间。废水处理后，经测试符合国家工业废水排放标准，减少污染物的排放量，取得较好的效果。1988年县化肥厂利用锅炉的煤渣，造气炉的碳化煤灰，生产煤灰碳化砖，创产值12.5万元，实现利润2.5万元。
在治理老污染源的同时，严格执行国家关于环境保护的法律法规，控制新的污染源产生。加强对新建项目的管理，对新建或扩建项目实行“三同时”，即：污染治理工程应与主体工程同时设计、同时施工、同时投产，严格执行对百万元以上工程环境影响评价制度，百万元以下项目，要填写环境影响报告表，严格执行审批手续。
加强自然保护，促进生态平衡。大力开展植树造林，封山育林，增加植被覆盖率，减少水土流失面积，积极推广生态农业，先后建立小格里陆生资源保护区，奎湖水生资源保护区，蒲桥生态农业示范农场。同时，加强对野生珍稀动植物的保护，制定对扬子鳄等国家一类野生动物保护办法。环保部门还配合农、林、工商管理部门，开展保护珍稀动物和有益生物的宣传和管理，及时查处捕卖青蛙、滥捕珍贵野生动物的事件。