一、堤防工程
三国.吴黄武五年(226年)，为军需粮秣计，倡导“表令诸将增广农田”，于湖县(今当涂县)设督农都尉治，对古丹阳湖区军屯。吴永安二年(259年)，太都尉严密建丹阳湖作浦里塘(今大公圩前身)，后因财力、人力不济而停建。建衡元年(269年)又在古丹阳湖区陆续围垦圩田，今大公圩、金宝圩、万春圩等由此而起。三国时期吴国为江北含山、和县等地圩区的灌溉和防洪安全，在牛屯河上建铜城闸，使含山、和县七十二圩环200里之域免遭洪水威胁，30万亩圩田均得灌溉之利。
东晋时期，洛邑倾覆，中州士女避乱江南者十之六七，晋明帝太宁元年(323年)，“王敦移镇姑熟屯于湖”，其间约二年时间，军队屯于丹阳湖区。
唐朝盛期，重视农业发展，大力屯田，规模、范围都较大。据北宋范仲淹追忆：“江南旧的圩田，每一圩方数十里如大城，中有河渠，外有门闸，旱涝不及，为农美利。”
北宋元丰五年(1082年)，在巢湖北面的南淝河下游滩地筑堤开田，有“官圩”、“私圩”之分。至南宋隆兴年间(1163～1164年)，合肥即有官圩36处。《宋史叶衡传》载：“合肥滨湖圩田四十里，募民以耕，岁可得谷数十万，蠲租税二、三年后…阡陌成，仿营田，官私各收其半”。巢湖之东筑有无为县嘉诚圩、庐江县杨柳圩等。江南芜湖县筑有易泰、陶辛、政和、行春、保丰、永丰诸圩。当涂县筑有连千圩，铜陵县有仁丰圩等。宋嘉时(1060年前后)即有“宣池(宣州、池州)之间圩之沉者千馀区”，加之江北之圩，总数不下二千馀区。
北宋末年，都城迁至浙江临安，江南遂成为政治、经济中心。乾道年间(1165～1173年)曾设招田之官，大兴围湖造田，促进了江南圩堤建设。当时有“上通建德(今东至县)，下达当涂，千里江湖绕一圩”的盛况。
明、清时期，政治局面相对稳定时间较长，圩区开发又有较大进展。明永乐元年(1403年)筑“麻、沣二湖圩田...起桃花桥迄含山县界三十里”。永乐三年(1405年)无为县始筑江堤，万历年间又筑神塘堤及头坝、二坝、三坝，并且联并部分圩堤。弘治二年(1489年)在丹阳、固城两湖之间筑南荡圩。万历十年(1582年)筑南陵县下林都圩。万历四十一年至四十二年(1613～1614年)筑铜陵县百家墩至胭脂夹的江堤，长80里，保护仁丰诸圩。
民国时期，沿江一带的地主及安庆、芜湖、合肥、南京等地的资本家、达官仕绅，组建垦务公司，投资垦殖。在沿江的芜湖、枞阳、贵池、东至、宿松、望江一带圈筑圩堤。同时，国民政府还投资或组织堤工委员会集资，修建圩堤和涵闸斗门，在一些小型支流上建控制闸，促进了无为、同马、枞阳等江堤的进一步封闭和江南秋江大圩联并。
据历史资料记载，三国时期至民国年间，安徽省沿江地区累计成圩2370处。其中三国时期在当涂、芜湖、宣城、含山四县筑圩11处；晋代在芜湖、当涂二县成圩6处；唐代筑圩11处，宋代筑圩117处，明代在沿江两岸的20多个县中共圈圩576处，清朝在沿江筑圩达1415处，民国时期成圩233处。至建国初期，沿江圩区共有大小圩口2426处，圩堤总长7756.2公里，配套中、小涵闸1272座，圩区耕地面积678.03万亩。其中万亩以上大圩116处，圩堤总长2453公里，耕地465.1万亩；5～10万亩的圩口16处，堤长368.3公里，耕地124.8万亩；10万亩以上的圩口6处，堤长417.8公里，耕地134.9万亩。其余2310处为万亩以下小圩，堤长5303.2公里，耕地221.93万亩。
1949年，长江遇大洪水，沿江堤防大多溃破，1950～1952年的水利兴修重点是沿江圩区的堵口复堤。有关地市县成立了堵口复堤指挥机构，大力整修堤防。对标准低的长江堤防加高培厚和局部退建；内河圩堤广泛培修，要求达到1949年最高洪水位不溃破。当时的皖南行署明确江河并重，民办公助，拨原粮6200万斤，修复江堤和重点河堤2070多公里，完成土方近1783万立方米。江堤修复标准为：堤顶超1949年最高洪水位1.0米，顶宽3～5米，外坡1∶3，内坡1∶2；内河修复标准为：堤顶高超1949年最高洪水位0.3米，顶宽2～4米，边坡1∶2。皖北地区确定以修复安庆专区的长江干堤为重点，兼顾巢湖专区，适当修复内河支堤。复堤标准：江堤与皖南相同。河堤超1949年洪水位0.5米，顶宽3米，边坡1：2。江北干堤共做土方1645万立方米，拨以工代赈原粮8202万斤。内河修复一般自力更生，合理负担，对轻、重灾区分别实行贷款和拨粮修堤。1950～1952年，沿江地区共整修圩口632个，堤长6500公里，并治理排水河沟33公里。修建大小涵斗门3000多座，建闸32座。
1954年长江遭遇特大洪水，沿江地区绝大多数圩口溃破，堤身决口达2000多处，堤防严重损坏。1954年冬起开始了新一轮堵口复堤。安徽省在芜湖设立了沿江复圩堵口工程指挥部，省委副书记、省政府副秘书长分别任正副指挥，有关地市县成立相应组织。堵口复堤规定的目标是：无为大堤等重要江河堤防，确保1954年实测最高洪水位不破；保护面积5万亩以上的江河堤防，确保1931年或1949年最高洪水位不破；一般江河堤防按原标准堵复。至1955年4月底，共做土方9580多万立方米，完成了堵口复堤任务。1956年又提出，无为大堤等重点江河堤防，堤顶高要达到超出1954年实测最高洪水位1～2米；一般堤防达1954年最高洪水位。1956年、1957年两年的水利兴修中，共做修堤土方11400多万立方米。至1960年，长江干堤等江河堤顶高程已超过1954年洪水位0.5～1.8米；一般圩堤也已达到1954年洪水位高程，使7000多公里的江河堤防提高了防洪能力，800多万亩的圩田及重要城市和基础设施有了初步安全保障。1969年，安徽省沿江地区出现了特大暴雨，两岸有1500多个内圩溃破或遭损。是年冬开始，经过两年时间的大规模的水毁修复和加高、加固圩堤，使沿江干堤和重点大圩基本恢复达到了规划的防洪标准。
1973年长江出现建国以来第四位的大洪水，发现沿江堤防还有许多薄弱环节，开始对险工险段进行重点除险加固。建立了兴修与防汛连贯责任制，加强各级领导责任制，采取定任务、定标准、定质量、定时间的办法，把土方任务、修堤要求层层落实到队、组、农户。重点加固的堤段和圩口有无为大堤的惠生段、同马大堤的宿松段，望江的四合圩、合成圩，安庆广济圩的丁马段等。
1983年长江出现建国以来的第二位的大洪水。1984年水阳江流域再次出现大水，有31个万亩大圩溃破。不少江堤和内圩堤防又暴露出了险工隐患。在灾后的大规模除险加固中，首先是全面摸清出险原因，统一规划；其次做好加固设计，彻底处理。1984年起，推广无为县万亩以上大圩的全面规划、分年实施、三年达标、拆屋让堤、统一放样、施工、验收的修堤经验，以后逐步带动了千亩以上小圩也开展“达标”修堤活动。长江干堤的加固维修仍按照防洪规划进行，逐段实施，一次做足标准。通过这次加固维修，长江干堤重点堤段基本达到或接近保障1954年型最高洪水位的防洪安全标准，内河重点圩堤面貌也焕然一新。
在进行圩堤建设的同时，沿江圩区还兴建了大量涵闸工程。至1988年底，涵闸总数达3670座。其中大型闸7座，中型闸45座，小型闸3618座。大、中型涵闸中有15座控制长江支流和湖泊，另外37座为长江干堤和重要河堤的防洪排灌涵闸。
二、联圩并圩
民国时期联圩并圩开始起步，芜湖县将原政和、同皋、杨德、永定、永成、永安、保丰、五丈湖等8个千亩至二、三万亩的圩口联并成一个大圩，初称八连圩；后又将易太、咸保、保定、南湖滩等5个圩口并入八连圩，改称十三连圩。
1949～1951年，芜湖县的南辛圩、小卞圩、小屯圩、小新圩等33个小圩相继并入万春圩、麻凤圩、三连圩、十连圩、保太圩等重点大圩。1949年，望江县的正兴、丰东、正德、马丰等四个小圩联并成四合圩。1952年由金堤、练成、万兴、万全等十个小圩合并成金练圩。
1954年防汛抗洪中，发现小圩堤线长，修防任务较重，标准难以提高，于是对圩口进行联并，以减轻防汛任务和提高圩堤的防洪标准。1954年11月，贵池县决定将秋浦河左岸的同乐、普庆、天成、长乐、建国、万生、万宝、万成、大农、民生等10个圩口并成一个秋江大圩。将大同一、二、三圩联成一个大同圩。1955～1968年，桐城县把人形河、柏年河之间的101个小圩并成一个大沙河联圩。工程分三期进行，最多时动员民工人数达3万余人。共退建、改建堤防102处，总长40多公里；疏河培堤70多公里，堵塞支流7条，建护岸8660米，修建涵闸199座。共完成土砂方960万立方米，石方1.95万立方米；防洪堤线由原来的216.7公里缩短至99.5公里。1956年枞阳县联成永丰、永久两大圩口。当涂县从1956年起，用7年时间，将全县103个小圩分别联并成一五圩、陈焦圩、下六圩、新博圩、大公圩等26个大圩。
50年代后期到70年代，结合河道治理，将皖河下游怀宁、望江一带的51个小圩联并成一个皖河联圩，共计缩短堤线230公里，提高了15万亩农田的抗洪能力，增加湖滩垦殖面积15万亩，平毁废埂扩大耕地1万亩。全椒县也结合兴修新河、跃进、如意三条排洪河道对官渡、赤镇、广平三乡的圩口进行联并，开挖了11条撇洪沟，将全县83个小圩并成22个大圩。来安县在整治来安河时，把沿河几十个小圩并成12个大圩。70年代杭埠河整治时，肥西联成三十二联圩和滨湖联圩。铜陵县治理顺安河时，将18个小圩并成东联、西联、顺安三个大圩。芜湖、东至、繁昌、和县、巢湖等县市也都按照规划，对傍山傍丘的小圩开挖撇洪沟，促进了联圩并圩。
1976～1978年，当涂县实施了薛、丹、博联圩工程。薛津、小丹阳、博望地区原有耕地22万亩，北倚山区，西南滨丹阳、石臼二湖。境内有大小河沟数十条，大小圩口30个，防洪堤线达180公里，堤身单薄，灾害频仍。联圩工程分两期，开挖了长11.8公里的丹阳新河和博望新河，分别通入姑溪河和石臼湖，解决山丘区的排水问题；同时开挖了9条撇洪沟，总长45.5公里，分排山水，做到丘圩分家；另建8座排灌站、4座排涝闸及控制闸3座，建配套桥闸44座，培修了堤防，联成了团结联圩、军民联圩和连迁圩等三个大圩，投入资金551.8万元。
1970年沿江圩区圩口总数为1902处，保护耕地面积757.12万亩。1980年圩口数为2161处，保护耕地面积832.08万亩。至1988年，通过联圩并圩，沿江圩区的圩口总数已由1949年的2426处减少至1922处，保护耕地面积由原来的678.03万亩增加至912.2万亩。建国后四十年，堤防处数减少了504处，保护耕地面积扩大了234万亩。沿江圩田中有60％分布在青弋江、水阳江流域和巢湖流域；无为、当涂、芜湖、宣城、贵池、和县、枞阳、望江、舒城等县、市圩田较多，均在40万亩以上。圩区耕地最多的是无为县，境内千亩以上的圩口有圩田102万亩，占沿江圩区耕地的11.2％；万亩以上的大圩有19处，耕地面积87.5万亩。其次为当涂县，圩区耕地约为65万亩，境内有江南第一圩——大公圩。