1978年开始，安徽农垦为了清除“左”的思想影响，落实党的干部政策，省农垦局印发了（78）垦政字第049号文件，决定由党的核心领导小组副组长、副厅长周长清负责复查平反冤假错案工作，并成立复查办公室，负责具体工作；各农场、公司由党委书记或副书记分工，负责抓案件复查，沿江普济圩、皖河、九成坂、华阳河四个大农场均成立冤假错案复查办公室。农垦系统共有复查办案人员132人。
为了把农垦各级干部的思想统一到中共十一届三中全会的精神上来，提高思想认识和政策水平，省农垦局采取分级培训和专业对口培训的办法，举办各种类型培训班61期，参加学习的有3440人，其中厅局办培训班6期、参加学习的有488人，包括场级领导干部98人，科级干部和主要业务骨干325人，从而推动了案件复查工作的顺利进行。据统计，农垦系统复查、纠正、平反“文化大革命”期间和“文化大革命”前的冤假错案和历史悬案2805人、错划右派改正的525人，其中属农垦系统改正的179人。与此同时，对各类科技人员进行归队调整工作，对77名学非所用的科技人员对口归队，解决了一部分科技人员家属户口和工作安排问题，挑选一大批德才兼备的知识分子进入各级领导岗位。到1983年底，农垦系统1701名大专院校毕业生中，有480名加入了中国共产党，其中中共十一届三中全会后入党的就有126名，担任副厅级领导职务的有2人，担任正副处级职务的领导有26人，担任科级干部的有244人。